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中國青年報客戶端北京6月18日電(中青報·中青網記者 邱晨輝)記者今天從中國科學院遺傳與發育生物學研究所獲悉,該所研究員田志喜等科研團隊在大豆泛基因組研究領域,成功突破傳統線性基因組的存儲形式,在植物中首次實現基于圖形結構基因組的構建,有望為大豆的育種改良按下加速鍵。北京時間6月17日,國際學術期刊《細胞》在線發表了這一成果。
據論文通訊作者、中國科學院遺傳與發育生物學研究所研究員田志喜介紹,大豆馴化起源于中國,隨后廣泛傳播于世界各地,是重要的糧食經濟作物。目前,我國大豆需求量大,加強大豆研究,提高大豆生產能力迫在眉睫。大豆基礎研究和分子設計育種,亟需能夠代表不同大豆種質材料的全新基因組資源。
此次研究中,中國科學院遺傳與發育生物學研究所等機構的科研團隊首先對來自世界大豆主產國的2898個大豆種質材料進行了深度重測序和群體結構分析,精心挑選出26個具有代表性的大豆種質材料,包括3個野生大豆、9個農家種和14個現代栽培品種。
隨后,科研團隊利用最新組裝策略,對這26個大豆種質材料進行基因組從頭組裝和精確注釋,構建了高質量的圖形結構泛基因組。這是一種新型的基因存儲形式,包含大豆幾乎所有的遺傳信息,囊括了一些重要品種獨特的基因結構變異。后者可以幫助解析大豆種皮的亮度、顏色變化等重要農藝性狀的調控機制。
田志喜說,該研究首次在植物中實現了圖形結構泛基因組的構建,對大豆基因的測序質量更高、還原程度更精準、包含的遺傳多樣性更充足。該基因組和相關2898個種質材料遺傳變異的發布,將有力推進大豆分子設計育種。
按照科研團隊的說法,傳統研究通常利用單個基因組來獲取一個物種的遺傳信息。由于不同個體間存在遺傳變異,單個基因組很難囊括該物種所有遺傳信息。此次構建囊括物種所有遺傳信息的泛基因組,既是前沿科學挑戰,也有很強的應用價值。
責任編輯:任潔