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增值稅方面，國家稅務總局《關于污水處理費不征收營業稅的批復》(國稅函[2004]1366號)明確，單位和個人提供的污水處理勞務不屬于營業稅應稅勞務，其處理污水取得的污水處理費，免征營業稅。各級政府及主管部門委托自來水廠(公司)隨水費收取的污水處理費，一般由自來水廠(公司)作為代收代付款項，定期支付給當地財政部門用于公益性污水處理建設，如更新當地水管網、處理城市生活污水等。財政部、國家稅務總局《關于污水處理費有關增值稅政策的通知》(財稅字[2001]97號)規定，對各級政府及主管部門委托自來水廠(公司)隨水費收取的污水處理費，免征增值稅。對于經由當地環保部門審批后建立的污水處理單位，通過一定的設備或工藝流程將污水凈化，達到排放或另行使用的標準，其向污水排放單位或個人等服務對象收取的污水處理費，按照國家稅務總局《關于從事污水、垃圾處理業務的外商投資企業認定為生產性企業問題的批復》(國稅函[2003]388號)規定，可以認定污水處理單位為生產性企業，其集中處理生產和生活污水屬于提供委托加工性質的勞務，所收取的污水處理費應當征收增值稅。

財政部、國家稅務總局《關于資源綜合利用及其他產品增值稅政策的通知》(財稅[2008]156號)規定，污水處理勞務免征增值稅、再生水免征增值稅。再生水是指對污水處理廠出水、工業排水(礦井水)、生活污水、垃圾處理廠滲透(濾)液等水源進行回收，經適當處理后達到一定水質標準，并在一定范圍內重復利用的水資源，再生水應當符合水利部《再生水水質標準》的有關規定。可見，對于污水處理和再生水，只要符合規定的標準，無論是內資還是外資企業，均可享受免征增值稅的優惠政策。

企業所得稅方面，《企業所得稅法》規定，從事符合條件的環境保護、節能節水項目的所得可以免征、減征企業所得稅。《企業所得稅法實施條例》明確，所稱符合條件的環境保護、節能節水項目，包括公共污水處理、公共垃圾處理、沼氣綜合開發利用、節能減排技術改造、海水淡化等。自項目取得第一筆生產經營收入所屬納稅年度起，第1年～第3年免征企業所得稅，第4年～第6年減半征收企業所得稅。《企業所得稅法實施條例》還規定，城鎮污水處理項目和城鎮垃圾處理項目購置并實際使用《環境保護專用設備企業所得稅優惠目錄》、《節能節水專用設備企業所得稅優惠目錄》和《安全生產專用設備企業所得稅優惠目錄》規定的環境保護、節能節水、安全生產等專用設備的，該專用設備投資額的10%可以從企業當年的應納稅額中抵免，當年不足抵免的，可以在以后5個納稅年度結轉抵免。

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